2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。李奥纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普利尔·奥尼尔成功接头，并和忍者神龟李奥纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳太罗汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。想到这里，石青峰脸上总上有了点笑容，忽然，他想到一个疑点，眉头一皱，马上喊停了还在撤退的百多个手下。那些手下见石青峰突然没有任何理由地叫他们停了下来，不由得一双双眼睛都疑惑地望着石青峰。
